Тутубалина Елена Викторовна

Профессор департамента анализа данных и искусственного интеллекта факультета компьютерных наук НИУ ВШЭ и старший научный сотрудник Научно-учебной лаборатории моделей и методов вычислительной прагматики того же факультета. Окончила Институт вычислительной математики и информационных технологий Казанского федерального университета по специальности «Прикладная математика и информатика» с квалификацией «Математик, системный программист» (2012). В 2016 году защитила кандидатскую диссертацию по специальности 05.13.11 на тему «Методы извлечения и резюмирования критических отзывов пользователей о продукции». В Высшей школе экономики работает с 2020 года.

В 2023 году защитила в НИУ ВШЭ диссертацию на соискание учёной степени доктора наук — «Модели и методы автоматической обработки неструктурированных данных в биомедицинской области». Защита прошла 7 ноября 2023 года в Совете по компьютерным наукам. Работа посвящена обработке биомедицинских текстов на основе языковых моделей архитектуры Transformer: в ней предложены модель связывания именованных сущностей, оптимизирующая сходство представлений сущностей и концептов, многоязычные модели распознавания именованных сущностей и мультимодальные методы обнаружения побочных реакций на лекарственные препараты. Отдельный результат — впервые созданные аннотированные корпуса текстов на русском и английском языках: NEREL-BIO из научных абстрактов, RuDReC из пользовательских отзывов о лекарствах, RuCCoN из электронных медицинских карт и корпус клинических испытаний; корпуса и кодовая база выложены в открытый доступ.

В блоке «Опыт работы» на сайте университета указаны её должности старшего научного сотрудника НИЛ «Хемоинформатика и молекулярное моделирование» Химического института им. А. М. Бутлерова КФУ и НИЛ «Медицинская информатика» Высшей школы ИТИС того же университета; в профиле ORCID к этому добавлены работа в Институте системного программирования РАН с 2021 года и с июля 2024 года — ведущим научным сотрудником и руководителем группы предметно-ориентированной обработки языка в Институте искусственного интеллекта AIRI. Руководила грантами РНФ № 18-11-00284 (2018–2020) и РФФИ № 19-07-01115, № 19-37-50001 и № 17-37-50045, участвовала в грантах РНФ № 15-11-10019 и РФФИ. Входила в организационные комитеты школы RuSSIR 2018 и конференции DAMDID 2019, в программные комитеты конференций RANLP, AIST, AINL и ISP RAS OPEN.

Публикуется в международных журналах и на конференциях по обработке естественного языка и биомедицинской информатике. Среди работ — «NEREL-BIO: A Dataset of Biomedical Abstracts Annotated with Nested Named Entities» в журнале Bioinformatics (2023), «NEREL: a Russian information extraction dataset with rich annotation for nested entities, relations, and wikidata entity links» в Language Resources and Evaluation (2024), «Multimodal model with text and drug embeddings for adverse drug reaction classification» в Journal of Biomedical Informatics (2022), «Cross-Domain Limitations of Neural Models on Biomedical Relation Classification» в IEEE Access (2022), «Measuring Chemical LLM robustness to molecular representations: a SMILES variation-based framework» в Journal of Cheminformatics (2025) и «Many heads but one brain: FusionBrain — a single multimodal multitask architecture and a competition» в «Компьютерной оптике» (2023). На конференциях Association for Computational Linguistics вышли «Lost in Translation: Chemical Language Models and the Misunderstanding of Molecule Structures» (EMNLP 2024), «When Punctuation Matters: A Large-Scale Comparison of Prompt Robustness Methods for LLMs» (EMNLP 2025) и «Vote'n'Rank: Revision of Benchmarking with Social Choice Theory» (EACL 2023). Всего в профиле ORCID заявлено более ста работ.

Руководит диссертационными исследованиями аспирантов: под её руководством в 2022 году защищена работа З. Ш. Мифтахутдинова о моделях связывания именованных сущностей в биомедицинском домене, ведётся исследование А. А. Валиева о нейросетевых методах извлечения связей между именованными сущностями в биомедицинских текстах. В декабре 2024 года стала лауреатом Национальной премии «Лидеры ИИ — 2024», объявленной на международной конференции AI Journey. Владеет русским, английским и татарским языками.