Ефремов Роман Гербертович

Профессор департамента прикладной математики МИЭМ им. А. Н. Тихонова НИУ ВШЭ, доктор физико-математических наук (2000), кандидат физико-математических наук (1986), профессор (учёное звание, 2007). В 1983 году окончил Московский инженерно-физический институт по специальности «Дозиметрия и защита» с квалификацией «Инженер-физик». В Высшей школе экономики работает с 2013 года; научно-педагогический стаж, по данным университета, — 42 года. Основное место работы — Институт биоорганической химии им. академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН, где он прошёл путь от научного сотрудника (1986–1990) и старшего научного сотрудника (1990–2001) до ведущего научного сотрудника (2001–2007). С 2007 года заведует Лабораторией моделирования биомолекулярных систем ИБХ РАН, с 2008 года — заместитель директора института по научной работе. В МИЭМ руководит научным семинаром по технологиям суперкомпьютерного моделирования.

Профессиональные интересы — вычислительная и компьютерная биология, молекулярное моделирование, структура и динамика биомолекул, биофизика. Работы посвящены поведению белков и пептидов в клеточных мембранах: олигомеризации трансмембранных доменов рецепторов, липид-опосредованной адаптации белков, свойствам липидных бислоёв и рациональному конструированию биологически активных соединений. Руководил грантами РНФ «Компьютерный анализ структурно-функциональных аспектов олигомеризации трансмембранных доменов рецепторов сигнальных систем клетки» (2014–2016), проектами Программы Президиума РАН по молекулярному моделированию пептидов и белков в мембранах (2013–2017) и мультимасштабному моделированию мезоскопических биомембранных систем (2012–2014), а также двумя грантами РФФИ (2013–2015 и 2016–2018).

В магистратуре МИЭМ по направлениям «Прикладная математика» и «Прикладная математика и информатика» читает курс «Компьютерная молекулярная биология и медицина» (в отдельные годы — в англоязычной версии Computer Molecular Biology and Medicine) и ведёт семинар наставника «Математические методы и компьютерные технологии»; в наборе 2026/2027 учебного года — семинар наставника «Системы управления и обработки информации». Руководил магистерской диссертацией о структурно-функциональных зависимостях в альфа-гарпининах (2014–2016).

По данным профиля, опубликовал 163 статьи в реферируемых изданиях, монографию и три учебных пособия; индекс Хирша по Web of Science — 28, число цитирований по состоянию на июль 2016 года — 2370. Среди недавних работ — «Structure-based prediction of T cell receptor recognition of unseen epitopes using TCRen» в Nature Computational Science (2024), «Structure-function analyses of human TRPV6 ancestral and derived haplotypes» в журнале Structure (2025), обзор «The coronavirus spike HR2 domain: an obscure player entering the limelight during membrane fusion?» в Biochimica et Biophysica Acta – Biomembranes (2025), «Transmembrane Domains of Bitopic Proteins as a Key to Understand the Cellular Signaling» в Russian Journal of Bioorganic Chemistry (2024) и обзор «Липид-опосредованная адаптация белков и пептидов в клеточных мембранах» в «Биологических мембранах» (2024).

Входит в редколлегии журналов International Journal of Molecular Sciences, Scientific Reports и Biology Direct, с 2009 года — заместитель главного редактора журнала «Биологические мембраны», с 2007 года член редколлегии «Биоорганической химии». Состоит в Учёном совете ИБХ РАН и трёх диссертационных советах (ИБХ РАН, МГУ и НИИ биомедицинской химии РАМН), а также в Американском химическом обществе и Биофизическом обществе США. Получал надбавки за публикации в журналах из Списка А в 2023–2026 годах.